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- Global gene expression
- Genome-wide gene expressionを使った、遺伝子マッピングのレビュー
- Genetics of global gene expression Matthew V. Rockman and Leonid Kruglyak. Nature Reviews Genetics 7, 862-872 (November 2006)
- 実験技術と発現量の評価法については1990年代半ばからのマイクロアレイ体系的発現解析の知見が蓄積。それをマッピングに拡張。
- Genome->Transcriptome-...->Phenomeの流れの中でGenome直下流の量的形質がTranscriptome
- 遺伝子‐個体レベル形質関連と遺伝子‐トランスクリプトームレベルの形質(発現状態)との共通域をマッピング
- DNA上の位置と発現との関係は大きく2タイプ、近傍のcis効果(local)と遠隔のtrans効果(distant)。
- 発現QTLは多ローカスエフェクトと想定されているが、QTLマッピングの成功例は単ローカス形質のみである点、Challenging
- Allele-specific 発現定量技術の取り込み(local 効果)
- Global gene expression における hot spots
- 多くの遺伝子の発現と関連を持つDNA領域。