Whole-genome association (WGA) studies でのマーカー選択論概説

• A gene-centric approach to genome-wide association studies Eric Jorgenson and John S. Witte. Nature Reviews Genetics 7, 885-891 (November 2006)
• マーカーの配置
  
  • 選び方
    
    • Quati-random or anonymouos SNPs
    • LD-based tag SNPs
  • 配置の仕方
    
    • Map-based
    • Gene-centric (Gene-based)
• 数とCoverage
  
  • 500K-1000Kといえども、カバーしきれていないか(あるマーカー配置で検出されたものが、別の配置では検出されない実例あり)
• Gene-cetricでスタートしたGWA。HapMapでmap-based、そして、検出パワー等も加味し、また、Gene-centric markersの情報の増加も加味して、どちらの方法にもPros and consあり・・・