遺伝子多型解析を数か月でできるようになるために〜第4回
- 『Applied Statistical Genetics With R』の読み会シリーズの目次
- 2011/06/25実施
- 2章の残り
- 遺伝的モデル
- 優性・劣性というモデル
- そのどちらとも言えないモデル
- 「中間型」の意味
- 簡単な「中間型」
- 平均
- 相加平均と相乗平均
- 平均
- 本当の「中間型」
- 「ちょうど中間(相加・相乗の平均)ではない」
- 「状況に応じて発揮される機能の大きさに差がある」
- 簡単な「中間型」
- 「中間型」の意味
- 遺伝的モデル
- 3章
- LD
- と
- は
- は組換えのありなし
- と
- LDindicesの値はとその信頼度
- 信頼度はに染色体本数をかければ、それが値になって、p値を出せる
- HaploviewではLODで同様に信頼度を評価できる
- LDplotを描くためのパッケージと関数
- LD
install.packages("LDheatmap") library(LDheatmap) LDheatmap(Actn3AllSnps, LDmeasure="D'",color=rainbow(100))