アプリの比較

• 血縁関係があるとき、アレルがシェアされる
• そのアレルの由来が「同祖」であることがIBD
• IBDであることは、家系情報を使って、そのアレルが確かに伝達されたと言えるときには、それと知れる
• GWASデータのときなどは、「アレルシェア」が染色体位置として途切れることなくつながっていることがIBDであることの傍証となる
• それをするのにいくつかのアプリがある(らしい)が、その比較を含めて
• こちらが隠れマルコフを使った方法の論文で、他のアプリとの比較もある
  • そのアプリのホームページ(こちら)
  • PLINK等との比較結果(こちら)