値を見て、2値判断をする
- 検査値が連続的
- それを見て、陽性・陰性に判定を分けたい
- 感度・特異度
- PPV・NPV
- 陽性・陰性の2値に分けてしまうと、「どっちつかず」の部分の情報がもったいない
- 陽性確率p、陰性確率1-pのように出てくると、ある意味、便利
- Rでは、ROCRパッケージなど(こちらの記事も参考)
- こちらの続きでもある
## computing a simple ROC curve (x-axis: fpr, y-axis: tpr) library(ROCR) data(ROCR.simple) pred <- prediction( ROCR.simple$predictions, ROCR.simple$labels) perf <- performance(pred,"tpr","fpr") plot(perf) ## precision/recall curve (x-axis: recall, y-axis: precision) perf1 <- performance(pred, "prec", "rec") plot(perf1) ## sensitivity/specificity curve (x-axis: specificity, ## y-axis: sensitivity) perf1 <- performance(pred, "sens", "spec") plot(perf1)