代数統計ソフトウェア

• 代数統計はデータの構造(グラフや群環体)に注目してデータを把握しようとします
• 便利なソフトウェアもあります
• 『Algebraic statistics for computational biology』：Part I(基礎)２計算機科学より
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• 2.5 ソフトウェア
  • 数学ソフト
    • "4TI2"
      • 非負整数の線形代数。トーラスモデルに有用
    • LAPACK/SVDPACK
      • 線型代数のFORTRAN ライブラリ、SVD(Singular value decomposition)のライブラリ
    • "MACAULAY2"
      • 代数幾何・可換環論のソフトウェア系
    • "MAGMA"
      • 代数、幾何、組み合わせ構造(グラフ・群環体)、グレブナー基底計算のソフトウェア
    • "MAPLE"
      • 計算機数学の汎用ソフト
    • "MATHEMATICA"
      • 計算機数学の汎用ソフト
    • "MATLAB"
      • 計算機数学の汎用ソフト、特に線形代数計算
    • "POLYMAKE"
      • ポリトープの取り扱い
    • "SINGULAR"
      • 多項式、可換環論、計算機代数幾何。代数統計にとても便利
    • "R"
      • 数学者にとってMATLAB相当。バイオコンダクタもお奨め