デンドログラムを二次元平面の上に描く

  • 二次元平面上に標本があり、それらの間に階層的クラスタリング構造が得られたとする
  • 二次元平面上に標本を配置しつつ、その平面から立ち上がるようにデンドログラムを描きたいかもしれない
library(FactoMineR)
# Compute PCA with ncp = 3
res.pca <- PCA(USArrests, ncp = 3, graph = FALSE)
# Compute hierarchical clustering on principal components
res.hcpc <- HCPC(res.pca, graph = FALSE)
plot(res.hcpc, choice = "3D.map")

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