2007-12-02から1日間の記事一覧

6 遺伝子多型分割表データの関連検定の見方 SNPケースコントロール関連検定に見る、いろいろな検定

公開アプリケーションはこちら SNPは3ジェノタイプ この3ジェノタイプは、それぞれがどんなリスクを持っているか、知れたものではない、という意味では、相互に順序できない3カテゴリともみなせる この3ジェノタイプは、2アリルのうちの片方に着目する…

7 傾向性の検定

傾向性の検定とは、カテゴリに順序をつけて、それに重み付けをし、その付与した重み付けの具合と一致しているかどうかと、すべてのカテゴリが平等であるかどうかと比較して、検定するものである フェノタイプ数が2の場合 SNPケース・コントロール関連解析に…

5 遺伝子多型分割表データの関連検定の見方 総論

ひとつの分割表から関連についての情報はさまざまなとりかたがある 『どんな関連』について調べたいかによる『いろいろ』 あるひとつの『どんな関連』についても複数の検定結果が得られる、という意味でも『いろいろ』 フェノタイプ数Np、ジェノタイプ数Ngの…

6 Heterogeneity test

すべてをばらばらに見る独立性検定 ジェノタイプに順序を想定することなく、フェノタイプにも順序を想定しない場合に行う検定 SNPの場合のヘテロのジェノタイプの疾患リスクがホモのジェノタイプのいずれよりもリスクが高い場合も、ヘテロのリスクがホモのリ…