Jonckheere-Terpstra
- Jonckheere-Terpstraでは、観測グループに順序を持ち込む。
- そのためにk個のサンプルグループが作る
ペア(
)について、次のようにランクに基づく量,
を算出し、それを全ペアについての総和
をとる。
は、
群の観測値について、
群の個々の観測値のうち、a個についてより大きく、b個について同一値だとしたときに、
という値を計算する。この値を
群のすべての観測値について足し合わせたもの。
- その上で、この量を観測総数、グループ別観測数にて次のような統計量とすると、これは、標準正規分布に従うとされ、p値を求めることができる。
- 3群以上、とはいえ、2群にて計算できないわけではないので、2群データ(2x3分割表)にKruskal-Wallis, Jonckheere-Terpstraをあてはめ、その検定結果が、それぞれ、2x3分割表カイ自乗検定や、トレンドテストと、どのような対応関係になるかを確認する→エクセルはこちら(アップロード予定)。
- これらを踏まえて、3ジェノタイプに量的データが得られた場合のKruskal-WallisとJonckheere-Terpstraを計算するエクセルはこちら
- ちなみに、式中の
の性質から、グループの順序を逆順にしても統計量は同一。