Haploviewを用いた連鎖不平衡マッピング実習

全９限

このシリーズでの取り扱い範囲

• 個々のSNPジェノタイプデータの評価(HWE検定)(記事はこちら)
• SNP-SNPペア間の連鎖不平衡の評価(記事はこちら)
• 領域の連鎖不平衡の評価と連鎖不平衡ブロックの作成(記事はこちら)
• 連鎖不平衡ブロック内ハプロタイプの推定(記事はこちら)
• タグSNPの選定(記事はこちら)
• ケース・コントロール関連検定
  
  • 単一SNPでの関連検定(記事はこちら)
  • ブロックハプロタイプでの関連検定(記事はこちら)
  • 多点解析補正(記事はこちら)
    
    • Bonferroni補正とPermutation補正
    • 領域中複数SNPの関連検定結果の多点解析補正
    • 複数ハプロタイプの関連検定結果の多点解析補正
• 各解析の出典一覧はこちらで。