Haploviewを用いた連鎖不平衡マッピング実習



全9限

このシリーズでの取り扱い範囲

  • 個々のSNPジェノタイプデータの評価(HWE検定)(記事はこちら)
  • SNP-SNPペア間の連鎖不平衡の評価(記事はこちら)
  • 領域の連鎖不平衡の評価と連鎖不平衡ブロックの作成(記事はこちら)
  • 連鎖不平衡ブロック内ハプロタイプの推定(記事はこちら)
  • タグSNPの選定(記事はこちら)
  • ケース・コントロール関連検定
    • 単一SNPでの関連検定(記事はこちら)
    • ブロックハプロタイプでの関連検定(記事はこちら)
    • 多点解析補正(記事はこちら)
      • Bonferroni補正とPermutation補正
      • 領域中複数SNPの関連検定結果の多点解析補正
      • 複数ハプロタイプの関連検定結果の多点解析補正
  • 各解析の出典一覧はこちらで。