ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ

2007-10-17

いわゆるトレンドテスト(additive model)

additive modelでのトレンドテスト統計量は、 $\{w_0,w_1,w_2\}=\{0,0.5,1\}$ のように、３ジェノタイプに均一間隔の重みをつけたものである。 $\{w_0,w_1,w_2\}=\{0,1,2\}$ としても $\{w_0,w_1,w_2\}=\{1,2,3\}$ としても、 $\{w_0,w_1,w_2\}=\{-10,0,10\}$ としても均一間隔である限り統計量は変わらないことに注意する
$f(r)_{additive}=\frac{1}{2}Dr_1+Dr_2$ , $g(r)_{additive}=\frac{1}{n}(\frac{1}{4}(n_0n_1+n_1n_2)+n_0n_2)$
したがって、
$Y^2_{additive}=\frac{n}{r}\frac{n}{s}\frac{(\frac{1}{2}Dr_1+Dr_2)^2}{\frac{1}{n}(\frac{1}{4}(n_0n_1+n_1n_2)+n_0n_2)}$

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