マルチプルテスティング補正に多変量正規分布
Am.J.Hum.Genet 81 1158-1168(2007) by KN Conneely and M Boehnke
So Many Correlated Tests, So Little Time! Rapid Adjustment of P Vaoues for Multiple Correlated Tests.
こちら
サマリー
GWAにおいては、複数テスト間の相互関係はいろいろである。マーカー間のAllelic association, 1SNP に複数のテストを行う問題、同一検体に複数の形質を観測する問題。
この相互関係があることによって、個別仮説のnominal Pの分布はいわゆるFWER的な補正が適さないことが知られている。
それを、すべての仮説をテストするべく、ジェノタイプとその捉え方(複数テスト)を逐一、扱い、また、複数のフェノタイプについても並列で扱い、それらのクロネッカー積で表される項を取ること、また、そのすべての仮説統計量に、仮説間関係は許すものの、それ以外は、簡単な漸近近似分布を仮定することによって、マルチプルテスティング補正を行おうというもの。
アプリケーションのリンクはこちら。
