long non-coding RNA

• 文献：Long non-coding RNAs: insights into functions. TR Mercer et al. nat reviews genet 10:155-159 2009
• "RNA world"という仮説
  • DNAに遺伝情報の伝達を担わせるより以前に、生物はRNAによって生き、遺伝情報を伝えていたとする仮説
  • 情報保存はより安定なDANに譲り、触媒機能はタンパクに譲り、そのブリッジの役割としてRNAがある、という仮説
• long ncRNAは、仮の定義として200ヌクレオチド超と言えるか・・・
• long ncRNAは、タンパクをコードしないものと考えてよい
• ncRNAはcoding RNAの少なくとも４倍超の転写をされるらしい
• long ncRNAの位置はcoding RNAや短いncRNAの位置と重なったり相互に互い違いに(interspersed)なったりして、複雑
• 本当に複雑
  • trans-spliced transcripts:?
  • macroRNAs:genome上の非常に長距離を超えて作られる
  • multigene transcripts: 複数の遺伝子を超えて作られる、とか、染色体を超えて作られたり・・・
• 発生初期に特に実在・機能性重要な例があるようだ
  • まだ定見とは言い難い
• long ncRNAの機能
  • 近傍のcoding genesをtrans形式で発現制御する？？？
  • epigenetic changesを介する？？(Chromatin modifying complexesのリクルート)
  • 転写調節？？
    • Proximal promoterからlong ncRNAができて、それがRNA-binding タンパクを呼び込んで転写に関わらせる？？
    • 転写活性複合体のコファクタとして働く？？
    • 転写活性を持つマシナリ複合体の調整作用を持つ？？
    • プロモータ選択に関わることでRNAポリメラーゼの活性を調節する？？
    • Post-transcriptional調節？？
      • 核酸高分子として、相補鎖配列を認識できることから、転写物の転写後調節を、配列特異的に行うことができる？？