ヒトのゲノムと遺伝子の統計 駆け足で読む『Quick Reference』of 『Human Molecular Gentics』

• ヒトゲノム構成要素の大きさ
  • ミトコンドリアゲノム　16.6kb
  • 核ゲノム　3.1Gb
  • ユークロマチン部分　2.9Gb(〜93%)
  • 高度に保存された部分　〜150Mb(〜5%)
  • タンパク質コード部分　〜35Mb(〜1.1%)
  • その他の高度に保存された部分　〜115Mb(〜3.9%)
  • 重複セグメント　〜160Mb(〜5.5%)
  • 高度繰り返し領域　〜1.6Gb(〜50%)
  • 構造的ヘテロクロマチン　〜200Mb(〜7%)
  • トランスポゾンに由来する繰り返し配列　〜1.4Gb(〜45%)
  • １本の染色体あたりの長さ　48Mb-249Mb
• 遺伝子数
  • 核ゲノム　>26,000
  • ミトコンドリアゲノム　37
  • タンパク質コーディング遺伝子　〜20000-21000
  • RNA遺伝子　>6000 ???
  • タンパク質コーディング遺伝子に似たPseudogenes　>12000
• 遺伝子の密度
  • 核ゲノム　120kbに１個
  • ミトコンドリアゲノム　0.45kbに１個
• タンパク質コーディング遺伝子の長さ
  • 平均長　53.6kb
  • 最小　a few hundred base pairs
  • 最大　2.4 Mb(dystrophin)
• タンパク質コーディング遺伝子のえくそん数
  • 平均エクソン数　9.8
  • 最大　363 (titin)
  • 最小　1
• タンパク質コーディング遺伝子のエクソンの大きさ
  • 平均　288bp
  • 最小　<10bp (4pbも)
  • 最大　18.2kb
• タンパク質コーディング遺伝子のイントロンの大きさ
  • 最小　<30bp
  • 最大　1.1Mb(KCNIP4)
• RNAの大きさ
  • 最小のnoncoding RNA　<20 nuclectides
  • 最大のnoncoding RNA　Several hundred thousand nucleotides; close to 1Mb
  • 最大のmRNA　>103 kb
• ポリペプチドの大きさ
  • 最小　10アミノ酸
  • 最大　34350アミノ酸