バイオマーカーの概説

• Strategies for discovering novel cancer biomarkers through utilization of emerging technologies, Nature Clinical Practice Oncology 5(10) 588-599 (2008)
• バイオマーカーの分類
  • 診断的バイオマーカー(スクリーニング用バイオマーカー)
  • 予後予測バイオマーカー
  • 層別化バイオマーカー
• バイオマーカーの性能評価
  • 感度・特異度
  • ROC curve (Receiver operatin characteristic curve)
• バイオマーカー探索に影響を与えている要素
  • ゲノム解読
    • ゲノム多型情報
  • バイオインフォマティクス
  • オミックス(ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオーム・メタボローム)
    • プロファイリング
  • 微小検体(単一細胞由来試料)
  • Comparative genomic hybridization(コピー数測定)
  • 高速シークエンス
• バイオマーカー探索の戦略・個々の武器
  • Gene-expression profiling
  • Mass-spectrometry-based proteomic profiling
  • Peptidomics
• バイオマーカー探索の諸相
  • Preclinical explaratory studies
  • Assay development and validation
  • Retrospective longtudinal clinical repository studies
  • Prospective screening studies
  • Randomized control trials