2013-08-08

統計遺伝学のための医学概論

医学医学概論

統計遺伝学では、医学関連のデータがなんでもやってくる。基礎系・臨床系を問わず
非医学系出身の大学院生は医学概論の単位を取得することで医学の概観をつかむことを制度上は求められるわけだが、
医学科の６年間で
- 『講義としての医学概論→正常の基礎医学→病的な基礎医学→病気について→臨床の診断・治療とは何か→診断(治療)の技術』という経路をたどったり
- 『講義としての医学概論→(正常基礎・病気の基礎・臨床)』とシステムで串刺しにしたりもするが
- こういった感じの道のりを経たうえで、再度『医学を概観』して得られるのが『医学概論』なわけで、そうそう、簡単ではない
じゃあ、どうする…
ひとまず、『絵』にしてみる
DOTフォーマットでエンコーディング=UTF-8のファイル"myIgaku2013.txt"から

dot -Kneato -Tsvg myIgaku2013.txt -o myIgaku2013.png
dot -Kdot -Tsvg myIgaku2013.txt -o myIgaku2013.svg

strict graph G{
	graph [charset="UTF-8",fontname="MS UI Gothic"];
	node[charset="UTF-8",fontname="MS UI Gothic"];
	edge[charset="UTF-8",fontname="MS UI Gothic"];

	graph[label="私のための医学",labelloc = t];
	subgraph sub_kiso {
		node [style=filled,color="#00BFFF"];
		b1 b2 b3 b4 b5 b6 b7 b8 b9 b10 b11 ;
		label = "基礎";
	}
	subgraph sub_system {
		node [style=filled,color="#EE82EE"];
		s1 s2 s3 s4 s5 s6 s7 s8 s9 s10 s11 s12 s13 s14;
		label = "システム";
	}
	subgraph sub_rinsho {
		node [style=filled,color="#FFA500"];
		r1 r2 r3 r4 r5 r6 r7 r8 r9 r10;
		r11 r12 r13 r14 r15 r16 r17 r18 r19 r20;
		r21 r22 r23 r24 r25 r26 r27 r28 r29 r30;
		label = "臨床";
	}
	subgraph sub_rinsho2 {
		node [style=filled,color="#A52A2A"];
		R1 R2;
		label = "臨床２";
	}

b1 [label="解剖学"];
b2 [label="組織学"];
b3 [label="生理学"];
b4 [label="生化学"];
b5 [label="薬理学"];
b6 [label="免疫学"];
b7 [label="微生物学"];
b8 [label="病理学"];
b9 [label="法医学"];
b10 [label="発生"];
b11 [label="遺伝学"];

r1[label="循環器科"];
r2[label="消化器科"];
r3[label="肝胆膵科"];
r4[label="呼吸器科"];
r5[label="神経科"];
r6[label="救急医学科"];
r7[label="内分泌科"];
r8[label="膠原病科"];
r9[label="血液科"];
r10[label="感染症科"];
r11[label="腎臓科"];
r22[label="代謝科"];
r30[label="アレルギー科"];
r12[label="婦人科"];
r13[label="産科"];
r14[label="小児科"];

r15[label="整形外科"];
r16[label="泌尿器科"];
r17[label="皮膚科"];
r18[label="眼科"];
r19[label="耳鼻咽喉科"];
r20[label="放射線科"];
r21[label="精神科"];
r23[label="麻酔科"];

r24[label="心臓血管外科"];
r25[label="呼吸器外科"];
r26[label="消化器外科"];
r27[label="肝胆膵外科"];
r28[label="脳神経外科"];
r29[label="乳腺外科"];

R1[label="内科(切らない)"];
R2[label="外科(切る)"];

s1[label="循環系"];
s2[label="外皮系"];
s3[label="骨格系"];
s4[label="生殖系"];
s5[label="消化系"];
s6[label="泌尿器系"];
s7[label="呼吸系"];
s8[label="内分泌系"];
s9[label="リンパ系"];
s10[label="筋系"];
s11[label="神経系"];
s12[label="免疫系"];
s13[label="代謝系"];
s14[label="感覚器系"];


	subgraph edges {
		edge[style=bold];
b1 -- b2[label="スケール"];
b4 -- b5[label="分子"];
b6 -- b7[label="外因対処"];
b8 -- b9[label="原因推定"];
b1 -- b10[label="形態"];
b2 -- b8[label="顕微構造"];

r1 -- s1 -- r24;
r2 -- s5 -- r26;
r4 -- s7 -- r25;
r3 -- s5 -- r27;
r3 -- s13 -- r27;
r5 -- s11 -- r28;
r5 -- s11 -- r21;
r21 --s11 -- r28;
r5 -- s11 -- s10 -- r8;
r5 -- s11 -- s10 -- s3 -- r15;
r15 -- s3 -- r8;
r8 -- b6 -- r30;
r30 -- r19;
r30 -- r17;
r12 -- r13;
r13 -- r14;
r11 -- s6 -- r16;
r3 -- s13 -- r12;
r1 -- r7 -- r11 -- r12;
r8 -- r4;
r8 -- r11;
r12 -- s6 -- r16;
r13 -- b10 -- r14;
b7 -- r10;
r13 -- b11 -- r14;
r13 -- s4 -- r14;
r13 -- s4 -- r16;
r7 -- s13 -- r12;
r7 -- s8 -- r12;

r17 -- s2 -- r29;
s2 -- s12;

s9 -- s12;
b6 -- s12 -- r8;
s9 -- r9;

b8 -- R2;
b8 -- R1;
b5 -- r23;

b1 -- R2;
b10 -- b11;
b4 -- s13;


s10 -- s11;
s10 -- s13;
s11 -- s14;
	}

	subgraph EDGES {
		edge[style=dotted];
R1--r1;
R1--r2;
R1--r3;
R1--r4;
R1--r5;
R1--r8;
R1--r9;
R1--r10;
R1--r11;
R1--r12;
R1--r14;
R1--r6;
R1--r20;
R1--r21;
R1--r22;
R1--r23;

R2--r6;
R2--r12;
R2--r13;
R2--r15;
R2--r16;
R2--r17;
R2--r18;
R2--r19;
R2--r24;
R2--r25;
R2--r26;
R2--r27;
R2--r28;
R2--r29;
b3 -- s1;
b3 -- s3;
b3 -- s5;
b3 -- s6;
b3 -- s7;
b3 -- s8;
b3 -- s9;
b3 -- s10;
b3 -- s11;
b3 -- s12;
b3 -- s13;
r6 -- s1;
r6 -- s2;
r6 -- s3;
r6 -- s4;
r6 -- s5;
r6 -- s6;
r6 -- s7;
r6 -- s8;
r6 -- s11;
r6 -- r1;
r23 -- r6;
r6 -- r1;

r18 -- s14;
r19 -- s14;
r5 -- s14;
r21 -- s14;
s2 -- s14;

}


}