転写酵素とそのDNAへの結合・クロマチンへの結合

Transcriptional regulation and the role of diverse coactivators in animal cells. Minireview by Robert G. Roeder, FEBS letters 579 (2005) 909-915

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• 転写調節の参加要素
  
  • Nuclear RNA polymerases(転写活性を有する酵素本体)
  • General initiation factors(DNAと結合する複合体)
  • Gene-specific (DNA-binding) regulatory factors
  • A variety of coregulatory factors(DNA配列より高次のRNApolリクルート調節)
    
    • As chromatin modifications
    • As participant of preinitiation complex
• 基本
  
  • 25000個のヒトコーディング遺伝子の転写調節
  • 3種類のnuclear RNA polymerases
    
    • RNA polymerase I:大きなribosomal RNAの転写をする
    • RNA polymerase II:coding genesやその他の小構造遺伝子を転写する
    • RNA polymerase III:ｔRNA, 5SRNA その他の小構造RNAを転写する
  • General initiation factorsを持つ
    
    • Several factors for RNApolI
    • TFIIA,TFIIB,TFIID,TFIIE,TFIIF,TFIIH for RNApolII
    • TFIIIC,TFIIIB for RNApolIII
      
      • Preinitiation complexes(PICs)が形成される
      • General initiation factorsは潜在的な転写能を有するが、in vivoにて転写が実行されるにあたっては、以降に述べる、転写活性因子やcofactorの存在が要求される
  • Sequence-specific DNA binding transcriptional regulatory factors
    
    • 遺伝子(周辺)の特異的DNA配列を認識した転写調節を行う因子
    • TFIIIAがそのひとつ(典型的なzind finger protein)
    • Zinc finger proteinはヒトゲノムで2500以上存在する、もっとも種類の多いDNA-binding調節タンパク
  • Cofactors
    
    • DNA-binding 調節因子と協同する諸因子
      
      • Chromatin構造の調節(ヒストンのacetylation,methylation,phosphorylation, ubiquitination)
      • Preinitiation compelexの形成・機能への影響