樹の描図



フリーアプリケーションTreeViewをダウンロードしよう(URL)

樹の構造をテキスト表現する方法もいくつかあるが、


(B1:0, (((B3:0, B5:2.00000):0, B2:1.00000):0, B4:0.00000):1.00000);

は、Newick書式(URL)と呼ばれ、樹を描くアプリケーションの複数で用いられている。TreeViewでは、このNewick書式のみを裸で持つテキストファイルを読み込んで樹を描くことができる。掲載図は、そのようにして描いたものである。

またTreeViewの他にも、系統樹関係のさまざまなアプリケーションが知られるが、簡便で多くの類似アプリケーションのフォーマットに対応しているTreeViewをお勧めする。Arlequinでは、アプリケーションNEXUS のフォーマットを使用し、出力されているが、Nexusのフォーマットは、内部にNewick書式を含んでいるのが以下のArlequin出力ファイルの抜粋部分が示すとおり。