ケースコントロール関連以外でパーミュテーションテスト(メモ)

plinkではQuantitative traitに対する単一SNP検定として、Waldテスト、尤度比検定を用いている。
こちらのレビュー(Crit Care. 2004; 8(3): 196–199.)の方が簡潔にまとまっている。
Statistics review 10: Further nonparametric methods
ちなみにこのレビューシリーズは、全14回(継続中?)
このシリーズ1−14回へのリンクはこちら

自前のパーミュテーションテストルーチンに入れるとして、参考となるサイトは。。。
こちら
ヨンクヒール・タプストラ検定Page's trend test・・・Kendall's tau
ヨンクヒール・タプストラ検定統計量は正規分布漸近近似
Rはこちら