HGV meeting 2008 @ Toronto

• CNV, Resequencing に向けた話しが中心
• メモ
  • Inversion　の検出
  • サンプル(別のデータ)をプールして、「部分集合」の考え方を入れつつ、情報を引き出すというアイディア
    • 非血縁関係者のIBD検出とそれによる個人間距離の定義、プロットのソフトウェア　
  • pharmacogenomics のサイト　
  • Enhancer browser
  • Vega annotation
    • pseudogene が多型により、geneに格上げ、そのアノテーション
    • HLAのハプロタイプ数種類に統合した上でアノテーション
    • Horton et al. PMID 18193213
  • microRNA
    • TargetScan
  • DNA molecule BARCODING
    • nanotechnology by Bionanomatrix
  • Metaanalysis for markers in LD each other and shared controls' effect on metanalysis
  • Polyphen to predict functional effect of polymorphisms
  • 1000 genome project at www.1000genome.org