PLS Partial Least Squares/Projection to Latent Structures

• chemometrics(計量化学)という分野があるという(日本語版Wiki、英語版Wiki)
  • 『大量のデータに対し、次元の圧縮・視覚化・回帰・判別・分類などを行うことによって、より構造的に理解しやすい形に加工し、実験結果の解釈に重要な情報を提供することを目的とする分野』とのこと
• chemometricsの手法の一つ(でオミックスに応用されている手法)にPLS(Partial Least Squares/Projection to Latent Structures)という手法がある
• PLS
  • PCAが分散を最大に取り出す軸を抽出するのに対して
  • PLSは多次元なXと多次元のYとの間をつなぐレコードを用いて、XとYとの両方を射影して「情報抽出」をする方法
  • PCAもPLSも線形代数的(多分)という意味では親戚
  • PCAについてはこちらを
• PLSのWiki(英語版)はこちら
• PLSをオミックスに応用することを説明したスライドはこちら(重いです)
• PLSを扱っている(らしい)Rのパッケージplsはこちら
  • その論文はこちら
• 日本語ではこちらやこちら