発現データの指標

• こちらの2013/01/18の記事で次世代シークエンサーを用いた発現量解析の話がある。量的指標としてRPKMについて言及している
• RPKM Reads Per Kirobase per Million mapped reads
  • こちら
• 関連して。RPKMとAverage normalized abundanceとその比較
  • こちら
• 指標は少なくとも１つは使えないと話にならない、その上で指標は指標に過ぎない（ある断面でしかない）ので、その指標の特性を知りつつ、別の指標についても検討することを忘れないようにしたい
• LDの指標のD'とr^2も指標（LDの断面の切り取り）