目次：ぱらぱらめくる『Deep Sequencing Data Analysis』
Deep Sequencing Data Analysis (Methods in Molecular Biology)
- 作者: Noam Shomron
- 出版社/メーカー: Humana Press
- 発売日: 2013/07/30
- メディア: ハードカバー
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- 統計っぽいところを中心に『ぱらぱらめくる』ことにしたい
- ６章までが総論
- ７章以降は各論
- 1. ハイ-スループット シークエンス実験入門。実験デザインとバイオインフォマティクス解析
- 2. 配列データを圧縮する(GReEnで)
- 3. Short Read Mapping の正確さ
- 4. ハイ-スループットデータのカバー具合に関する統計モデル
- 5. Deep Sequenceデータのアセンブル・アルゴリズム。基礎と気をつけるべきこと
- 6. エクソーム・シークエンシングのためのShort Read Mapping
- 7. Short ReadsからShort Tandem Readsの情報を取る
- 8. 疾患バリアントの検出のためのエクソーム・シークエンシング
- 9. Deep SequencingでmiRNAのRNA editing sitesを見つける
- 10. RNA SequencingでAlternative Splicing の起き方を調べる
- 11. ChIP-seqで転写因子結合部位を検出する。その方法の最適化
- 12. ChIP-seqデータの統計解析(MOSAiCSで)
- 13. cDNA LigationとMassive Parallel SequencingでReverse Transcriptase Termination Sitesを見つける
