SNPジェノタイプ２ｘ３テーブルからトレンドテスト

• SNPジェノタイプ２ｘ３表があるとする。
• アレル本数０,１,２本に関するトレンドテスト。
• 今、２ｘ３表のケースコントロール合算ジェノタイプカウントについて、ヘテロ人数がH、総人数がN、全体での２アレルの頻度がp1,p2とする。
• このとき、。
• 今、この２ｘ３テーブルから、アレルに関する２ｘ２表を作り、その２ｘ２表についてのカイ自乗値がCだったとしたら、トレンドテスト統計量(トレンドカイ自乗値)は、
• 
• Armitage-Cochranトレンド統計量は、Nに関する補正がなされて、
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