連鎖平衡を代数統計する

  • 2アレル多型が2つある。そのアレル頻度をそれぞれp1,p2,q1,q2とする
  • 連鎖平衡の下での4ハプロタイプの頻度をh1,h2,h3,h4とする
  • Singularを使ってやってみる
ring p=0,(p1,p2,q1,q2),lp;
ring h=0,(h1,h2,h3,h4),lp;
setring p;
map f = h,p1*q1,p1*q2,p2*q1,p2*q2;
ideal i0=0;
setring h;
preimage(p,f,i0);
    • -h1\times h4 + h2\times h3が出ます