2013-01-08 連鎖平衡を代数統計する 代数統計 連鎖平衡 連鎖不平衡 Singular 2アレル多型が2つある。そのアレル頻度をそれぞれp1,p2,q1,q2とする 連鎖平衡の下での4ハプロタイプの頻度をh1,h2,h3,h4とする Singularを使ってやってみる ring p=0,(p1,p2,q1,q2),lp; ring h=0,(h1,h2,h3,h4),lp; setring p; map f = h,p1*q1,p1*q2,p2*q1,p2*q2; ideal i0=0; setring h; preimage(p,f,i0); が出ます