- GWASでほとんど成果の上がっていない病的過程について考える
- その病的過程はエンティティとしての疾患の一部という意味で「サブ・最終フェノタイプ」
- その「サブ・最終フェノタイプ」は最終フェノタイプとしての疾患x複数に共有されている
- このようなサブ・最終フェノタイプに関して遺伝子の立場から知見を得るために、どんな方向への動きがあるだろうか?
- そんなことを考えてみる
- ゲノム→サブ・最終フェノタイプ の途中を解析する
- トランスクリプトーム・プロテオーム…
- これらの「オーム」層が得意なパスウェイ・ネットワーク・モジュール解析を行って、ゲノム-フェノタイプ関連と付き合わせる
- ゲノムと他オームとの組合せ(eQTLとか)や、オミックスくし刺し解析をする
- トランスクリプトーム・プロテオーム…
- ゲノム側を拡張する
- 表現型側を拡張する
- 複数フェノタイプの組合せ・たくさんのフェノタイプの組合せ(PAGE(Population Architecture using Genomics and Epidemiology )/PheWAS)によるPleiotropy
- それを実現するためのEHR-driven研究
- 表現型の精緻化
- この話は日本リウマチ学会(2013@京都)で
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